۲- هزینه‌ها و عوارض بالای ناشی از ساز و کار محیط کسب‌وکار که توسط بخش دولتی مرتباً به بخش خصوصی تحمیل می‌شود.
۳- نرخ بالای تورم.
۴- نرخ بالای منابع مالی ازجمله سیستم بانکی که بالاترین نرخ را در دنیا دارد.
۵- فرسودگی ماشین‌آلات، تجهیزات و ساختمان مرغداری‌ها به دلیل حاشیه سود پایین و توجه نکردن تولیدکنندگان به بازسازی و نوسازی آن به ویژه ضرر و زیان و رکود اقتصادی چند سال اخیر که مزید بر علت ذاتی آن شده است.
۶- پایین بودن بهره‌وری به‌دلیل ساختار سنتی صنعت.
۷- وجود عوامل واسطه‌ای فراوان در بین حلقه‌های مختلف تولید.
۸- نبود شرکت‌های بزرگ زنجیره‌ای.
۹- ساختار جزیره‌ای و پراکنده و خرده مالکی صنعت.
۱۰- نبود اعتقاد در تولیدکننده و سیاست‌گذار و تشکل‌های مرتبط بر امکان تولید محصولات صادراتی.
۱۱- سیاست‌های پرفراز و نشیب در برنامه‌ریزی تولید.
البته این انجمن، راهکارهایی را نیز برای حل مشکلات موجود مطرح کرده است. امکان تأمین تسهیلات ارزان برای این بخش، حمایت جدی از تشکیل زنجیره تولید، اختصاص بودجه برای اصلاح ساختار تأسیسات، ارائه مشوق‌های صادراتی، تدوین پروتکل‌های بهداشتی برای بهبود محیط کسب‌وکار و برداشته شدن سیستم‌های کنترلی در صورت باز شدن راه صادرات و بهبود شرایط تولید از مهم‌ترین مواردی است که مسئولان این انجمن بر آن تأکید دارند.
